Shinobi, pur essendo comunque un gioco a tempo, si differenzia da molti altri platform per la minor frenesia nel gioco, in quanto i nemici non vengono generati all'infinito e per lo più sostano in determinati punti dello schermo, cosicché si ha tempo per cercare come agire nei loro confronti e studiare il modo per non essere colpiti. Il gioco si presenta come un platform a scorrimento orizzontale, con la possibilità di accovacciarsi a terra; i pulsanti servono, nell'ordine, per colpire (se si è distanti dal nemico si lancia uno shuriken, altrimenti si affronta il nemico con pugni, calci o colpi di spada), saltare e utilizzare la magia ninja (ha l'effetto di ammazzare tutti i nemici comuni presenti nello schermo e indebolire i boss, ma si può utilizzare solamente una volta per scenario; nella terminologia videoludica viene chiamata smart bomb).
fonte:wikipedia